芝山岩的附近有兩條溪，南面是「外雙溪」，北面是「石角溪」。石角溪因為溪水混濁，所以當地人稱為「濁水港」。而「濁水港」這個名稱的由來，在當地傳說著一個淒涼的故事......

據說以前的濁水港是一條流水潺潺，清澈見底的美麗河流，也是當地居民的生活的主要水源。

清咸豐年間，漳泉械鬥的事件不斷，有一次漳州人打敗仗逃到芝山岩上，因芝山岩地勢險峻，泉州人雖久攻不下，但也不放棄，緊緊圍在山腳，漳州人被困於芝山岩上，雖有米糧但卻沒有水源。於是泉州人想出計策來引誘漳州人下山來，於是派人告訴在山上的漳州人：如果願意講和，可以每三個人將辮子綁在一起下山來，不過每一批下山的人之間要間隔五分鐘。

當夜住芝山岩上漳州人，有多人夢見開漳聖王告知他們其中有詐不要上當，但有幾個漳州人認為山上空有米糧卻沒有水，再僵持下去也不是辦法，不如去試試看，沒想到一下山就被泉州人帶到石角溪邊殺死，就算想逃時，辮子又結在一起根本跑不了。等到山上的漳州人發現時，已經被殺死好幾組人。鮮血染紅了清水溪流，染著鮮血的溪流從此以後不再澄清，濁水港這樣的名稱就被流傳了下來......

濁水港的源頭是陽明山，經過石角、下東勢而匯入外雙溪，是以前附近居民民生和灌溉用水的主要來源。民國68年修建環山公路時，將溪水由公路下方涵箱導引到外雙溪。在進行這個工程時，台北市工務局曾在石頭公附近挖到不少史前遺物及大量貝塚。